Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek4Q9Z1J2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nek4Q9Z1J2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms