Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cpne6Q9Z140 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cpne6Q9Z140 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cpne6Q9Z140 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cpne6Q9Z140 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne6Q9Z140 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms