Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dctn3Q9Z0Y1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dctn3Q9Z0Y1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms