Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xpr1Q9Z0U0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms