Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R4

Itsn1, Intersectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn1Q9Z0R4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itsn1Q9Z0R4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itsn1Q9Z0R4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itsn1Q9Z0R4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itsn1Q9Z0R4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itsn1Q9Z0R4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itsn1Q9Z0R4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itsn1Q9Z0R4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itsn1Q9Z0R4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Itsn1Q9Z0R4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Itsn1Q9Z0R4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Itsn1Q9Z0R4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itsn1Q9Z0R4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itsn1Q9Z0R4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itsn1Q9Z0R4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itsn1Q9Z0R4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itsn1Q9Z0R4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itsn1Q9Z0R4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Itsn1Q9Z0R4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itsn1Q9Z0R4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Itsn1Q9Z0R4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Itsn1Q9Z0R4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Itsn1Q9Z0R4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Itsn1Q9Z0R4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Itsn1Q9Z0R4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Itsn1Q9Z0R4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Itsn1Q9Z0R4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms