Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfn1Q9Z0I7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slfn1Q9Z0I7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slfn1Q9Z0I7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms