Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clcn5Q9WVD4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clcn5Q9WVD4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms