Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arpc1bQ9WV32 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arpc1bQ9WV32 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc1bQ9WV32 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc1bQ9WV32 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc1bQ9WV32 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc1bQ9WV32 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc1bQ9WV32 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc1bQ9WV32 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms