Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArcQ9WV31 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ArcQ9WV31 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms