Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp1a4Q9WV27 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms