Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnip1Q9WUU8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnip1Q9WUU8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms