Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn3Q9WUK7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms