Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mixl1Q9WUI0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.5 ms