Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pus1Q9WU56 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus1Q9WU56 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms