Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ggps1Q9WTN0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggps1Q9WTN0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms