Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam50bQ9WTJ8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam50bQ9WTJ8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam50bQ9WTJ8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms