Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TapbpQ9R233 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TapbpQ9R233 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms