Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Psma1Q9R1P4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma1Q9R1P4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psma1Q9R1P4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma1Q9R1P4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms