Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trex2Q9R1A9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trex2Q9R1A9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trex2Q9R1A9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms