Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpk1Q9R0M5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpk1Q9R0M5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms