Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plod1Q9R0E2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms