Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp11cQ9QZW0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp11cQ9QZW0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms