Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Npas3Q9QZQ0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Npas3Q9QZQ0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms