Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg1Q9QZE5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms