Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC2

Plxnc1, Plexin-C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnc1Q9QZC2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Plxnc1Q9QZC2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Plxnc1Q9QZC2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnc1Q9QZC2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms