Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exo1Q9QZ11 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms