Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYC3

Bhlha15, Class A basic helix-loop-helix protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha15Q9QYC3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlha15Q9QYC3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlha15Q9QYC3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms