Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr2e3Q9QXZ7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms