Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ6

Slco1a1, Solute carrier organic anion transporter family member 1A1, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1a1Q9QXZ6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Slco1a1Q9QXZ6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slco1a1Q9QXZ6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Slco1a1Q9QXZ6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Slco1a1Q9QXZ6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Slco1a1Q9QXZ6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Slco1a1Q9QXZ6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Slco1a1Q9QXZ6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Slco1a1Q9QXZ6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Slco1a1Q9QXZ6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Slco1a1Q9QXZ6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Slco1a1Q9QXZ6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1a1Q9QXZ6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Slco1a1Q9QXZ6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slco1a1Q9QXZ6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms