Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip4Q9QXN3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.4 ms