Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf3Q9QXK7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf3Q9QXK7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf3Q9QXK7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf3Q9QXK7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf3Q9QXK7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf3Q9QXK7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf3Q9QXK7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms