Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Copg2Q9QXK3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copg2Q9QXK3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms