Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mid2Q9QUS6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms