Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma6Q9QUM9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma6Q9QUM9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms