Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msh5Q9QUM7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msh5Q9QUM7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msh5Q9QUM7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msh5Q9QUM7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msh5Q9QUM7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msh5Q9QUM7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Msh5Q9QUM7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msh5Q9QUM7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms