Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkain4Q9JMG4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkain4Q9JMG4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkain4Q9JMG4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkain4Q9JMG4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain4Q9JMG4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkain4Q9JMG4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms