Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub1Q9JMG3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub1Q9JMG3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms