Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep4Q9JM96 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms