Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SrfQ9JM73 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrfQ9JM73 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrfQ9JM73 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms