Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cabp1Q9JLK7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cabp1Q9JLK7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms