Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr5Q9JLF7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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