Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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