Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gde1Q9JL56 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Gde1Q9JL56 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Gde1Q9JL56 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gde1Q9JL56 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gde1Q9JL56 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gde1Q9JL56 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gde1Q9JL56 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gde1Q9JL56 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gde1Q9JL56 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gde1Q9JL56 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gde1Q9JL56 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gde1Q9JL56 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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