Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccr10Q9JL21 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccr10Q9JL21 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccr10Q9JL21 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms