Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc5a3Q9JKZ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc5a3Q9JKZ2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms