Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms