Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx5Q9JKQ4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx5Q9JKQ4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms