Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtrQ9JKK8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrQ9JKK8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms