Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stx6Q9JKK1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx6Q9JKK1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx6Q9JKK1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms