Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mrpl39Q9JKF7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl39Q9JKF7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl39Q9JKF7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms